Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD6Q96NE9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD6Q96NE9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD6Q96NE9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms