Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF396Q96N95 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF396Q96N95 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF396Q96N95 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF396Q96N95 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF396Q96N95 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF396Q96N95 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZNF396Q96N95 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNF396Q96N95 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF396Q96N95 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF396Q96N95 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms