Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL15Q96M94 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL15Q96M94 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL15Q96M94 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL15Q96M94 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms