Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EP400Q96L91 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EP400Q96L91 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EP400Q96L91 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
EP400Q96L91 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms