Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GJD4Q96KN9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
GJD4Q96KN9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
GJD4Q96KN9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
GJD4Q96KN9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJD4Q96KN9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms