Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLPTM1LQ96KA5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPTM1LQ96KA5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms