Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LRRIQ1Q96JM4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
LRRIQ1Q96JM4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
LRRIQ1Q96JM4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
LRRIQ1Q96JM4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms