Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SGSM3Q96HU1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGSM3Q96HU1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGSM3Q96HU1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms