Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZC2HC1AQ96GY0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZC2HC1AQ96GY0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms