Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCARF2Q96GP6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCARF2Q96GP6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCARF2Q96GP6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms