Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL48Q96GC5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL48Q96GC5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL48Q96GC5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL48Q96GC5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL48Q96GC5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRPL48Q96GC5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL48Q96GC5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRPL48Q96GC5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms