Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF31Q96EP0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF31Q96EP0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF31Q96EP0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms