Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPS1Q96D71 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
REPS1Q96D71 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
REPS1Q96D71 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms