Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLCD1Q96CP7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLCD1Q96CP7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD1Q96CP7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms