Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF653Q96CK0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF653Q96CK0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF653Q96CK0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 978.1 ms