Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RUNDC1Q96C34 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RUNDC1Q96C34 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RUNDC1Q96C34 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms