Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD2Q96BF3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMIGD2Q96BF3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms