Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTSSAQ969W0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPTSSAQ969W0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms