Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC10Q969S8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC10Q969S8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms