Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GJA10Q969M2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJA10Q969M2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA10Q969M2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms