Protein–RNA interactions for Protein: Q92871

PMM1, Phosphomannomutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMM1Q92871 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMM1Q92871 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PMM1Q92871 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms