Protein–RNA interactions for Protein: Q92565

RAPGEF5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF5Q92565 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAPGEF5Q92565 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAPGEF5Q92565 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAPGEF5Q92565 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms