Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD6Q92537 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SUSD6Q92537 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUSD6Q92537 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms