Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf40Q8WZ69 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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