Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGDCC4Q8TDY8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGDCC4Q8TDY8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGDCC4Q8TDY8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms