Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PROKR1Q8TCW9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PROKR1Q8TCW9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms