Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBX8

PIP4K2C, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2CQ8TBX8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIP4K2CQ8TBX8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIP4K2CQ8TBX8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIP4K2CQ8TBX8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIP4K2CQ8TBX8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIP4K2CQ8TBX8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms