Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP61Q8NHU2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP61Q8NHU2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP61Q8NHU2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms