Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATL2Q8NHH9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATL2Q8NHH9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATL2Q8NHH9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms