Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP43Q8NFH3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP43Q8NFH3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUP43Q8NFH3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms