Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID1BQ8NFD5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID1BQ8NFD5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARID1BQ8NFD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID1BQ8NFD5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID1BQ8NFD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms