Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AVL9Q8NBF6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AVL9Q8NBF6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AVL9Q8NBF6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AVL9Q8NBF6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms