Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9T8

KRI1, Protein KRI1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRI1Q8N9T8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRI1Q8N9T8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRI1Q8N9T8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRI1Q8N9T8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRI1Q8N9T8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms