Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8N9G6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8N9G6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8N9G6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8N9G6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8N9G6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8N9G6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8N9G6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8N9G6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8N9G6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8N9G6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8N9G6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8N9G6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8N9G6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8N9G6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8N9G6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8N9G6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8N9G6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8N9G6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8N9G6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8N9G6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8N9G6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8N9G6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8N9G6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8N9G6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8N9G6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8N9G6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8N9G6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8N9G6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8N9G6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8N9G6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8N9G6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8N9G6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8N9G6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8N9G6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8N9G6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8N9G6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8N9G6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8N9G6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8N9G6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8N9G6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8N9G6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8N9G6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8N9G6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8N9G6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8N9G6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8N9G6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8N9G6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8N9G6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8N9G6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8N9G6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8N9G6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8N9G6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8N9G6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8N9G6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8N9G6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8N9G6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8N9G6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8N9G6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8N9G6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8N9G6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8N9G6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8N9G6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8N9G6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8N9G6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8N9G6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8N9G6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8N9G6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8N9G6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8N9G6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8N9G6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8N9G6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8N9G6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8N9G6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8N9G6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8N9G6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8N9G6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8N9G6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8N9G6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8N9G6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8N9G6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8N9G6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8N9G6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8N9G6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8N9G6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8N9G6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8N9G6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8N9G6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8N9G6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8N9G6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8N9G6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8N9G6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8N9G6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8N9G6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8N9G6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8N9G6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8N9G6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8N9G6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8N9G6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8N9G6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms