Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CSGALNACT2Q8N6G5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSGALNACT2Q8N6G5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSGALNACT2Q8N6G5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms