Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC33Q8N5R6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC33Q8N5R6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC33Q8N5R6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms