Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHISA5Q8N114 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHISA5Q8N114 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms