Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIMKLAQ8IXN7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RIMKLAQ8IXN7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIMKLAQ8IXN7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms