Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKL3Q8IVW4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
CDKL3Q8IVW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDKL3Q8IVW4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms