Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC50Q8IVM0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC50Q8IVM0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms