Protein–RNA interactions for Protein: Q86X45

LRRC6, Protein tilB homolog, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC6Q86X45 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC6Q86X45 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC6Q86X45 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC6Q86X45 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms