Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNMB4Q86W47 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNMB4Q86W47 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNMB4Q86W47 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms