Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACS2Q86VP3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACS2Q86VP3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACS2Q86VP3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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