Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF39Q86UA1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF39Q86UA1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF39Q86UA1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF39Q86UA1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms