Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF554Q86TJ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF554Q86TJ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms