Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
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