Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX20Q7Z614 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX20Q7Z614 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms