Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYSMD3Q7Z3D4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LYSMD3Q7Z3D4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD3Q7Z3D4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms