Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX8Q7RTT4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX8Q7RTT4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSX8Q7RTT4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSX8Q7RTT4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms