Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP3Q7RTS5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP3Q7RTS5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP3Q7RTS5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP3Q7RTS5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms